一艘巨大的外星无人探测器向地球航来，它不断地发出奇特的电波信号_：功!-/
率强大的?
!信号煮 -沸*+了海水，干扰了附近的星舰并造 `成了广泛的破坏。此;\*\时，詹-'/姆=斯·<柯克<:&中将与他的船员们在完成了让斯波克上校复活的任务后，驾驶着从-克林贡人那抢来的猛禽舰（被改&$=&名为“赏]/金号”）从#瓦肯星返!航，尽管他"们已经知道了_将''面临军 (!事法庭的指_%>\控：他们被指控盗窃了联邦星&,]舰进取 !(号，并对她的毁坏负有责任。在此`关头，尚在恢复中的斯波克发现这艘外星探测器正尝:<试与地球上的座,头鲸建立联^系；但不幸+>的是，早在3个?^]世纪前座头鲸就因过度\的(-捕猎而灭绝了。　　柯克命令“赏金号”进入引力弹射状态>，利用太阳的万]+!有引力而穿越时空来到20世纪后期。星舰=+于1986年抵达了美国加利福尼亚州.=的旧金山市，船员们[)>将星舰藏在金门公园#;的一处草坪上。此"后，他`们开-始:;寻找能[=与外星?
_探测器沟通的鲸&# '鱼^]::、[<能^将鲸鱼装在星舰_*上的容器，以及能让猛禽舰恢复能源供
应的物质——在星舰穿 越时空的>+&;旅途中能-^源几乎被耗尽。柯克与斯波克最终>获得了`#一*
位鲸类专家吉莉安·泰勒博`(
士的协助，她<在索萨利托市鲸鱼协会$%照料两头座%]#=头鲸。　　在经历了许多的困难后 (;——包括.'_让/泰勒相信他们的确来,!`自^/未来——进取号%+#的船员们成功地营救*了两头座头鲸，并将它,
!
们带到未来，及时地拯"救了地球。然后船员们被`)?带到了联邦委员会的面前，接受众多的>= 指控。没有被作为被告_
=的斯波克也与其他船员们站在了;_)一起。最后，鉴于他们新近的_'英勇表现，_%(除了对柯克中将的控告外，针对/(其余被告的所有控=!告都 \-被撤销。^,柯克以作为一名上级军官却违背命令;)的罪行被判有罪，并]"象征性,/地>^%被降职为上校以示惩(^]'戒；但作为对他英勇行为[![+的[=表彰，他被任命为<联邦星舰进取号-A的舰长。与进取)号船员一同来到23世纪的泰勒博士，决定加入星$=际舰,+队并成为一名科学官。　　/!作为情" $节框架的支线剧情，展现了斯波克逐 /渐地!恢复了他>)/:!的记忆/、他此前获得并接受的@>+人.^=类传统，以_及他对自% 己情感的承认。在*影片@+^开始时，他不明白母亲询问他的&“感$觉=" ”有何意义；_$`但到最 %(后，他已.%能足够@)]意识到“感觉”对$_人类的重要性，并'^托父亲告诉母亲，他“感"=^觉良好”。